As espécies de peixes de água doce encontradas no estado de São Paulo distribuem-se entre quatro bacias hidrográficas principais: Alto Paraná, Paraíba do Sul, Ribeira de Iguape e um conjunto de pequenas drenagens costeiras que desembocam diretamente no oceano Atlântico. No mundo existem cerca de 28.000 peixes, no Brasil 2.587, no Estado de São Paulo são estimadas cerca de 400 espécies.
Ordem Characiformes
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Ordem Clupeiformes
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Ordem Cypriniformes
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Ordem Cyprinodontiformes
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Ordem Gymnotiformes
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Ordem Myliobatiformes
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Ordem Perciformes
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Ordem Pleuronectiformes
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Ordem Siluriformes
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Ordem Synbranchiformes
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Importante: embora a distribuição e ocorrência das espécies contidas neste site baseia-se fielmente através de publicações científicas, a lista poderá apresentar uma pequena margem de erros na localização de algumas espécies, devido a atualizações ou pelo agravante de espécies invasoras se estabelecerem em algumas regiões sem o conhecimento da comunidade científica.